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ドメイン設定が「反映待ち」の状態ですが、表示が消えるまでにメールアドレスの作成などをすることは可能ですか？

はい、ドメイン設定が「反映待ち」の状態でも、メールアカウントの作成やサイトデータのアップロード作業をすることが可能です。

「反映待ち」の表示が消えた時点で、作成済みのメールアドレスなどが利用できるようになります。